Oltre a fungere da interfaccia tra gli uffici federali e il capodipartimento, la Segreteria generale svolge compiti di pianificazione, coordinamento e controllo, amministra le risorse e fornisce servizi di consulenza all'intero Dipartimento. Alla Segreteria generale sono aggregati la segreteria della Commissione federale contro il razzismo, il Servizio per la lotta al razzismo e l'Ufficio federale per le pari opportunità delle persone con disabilità.
Segretario generale: Stefan Hostettler
